Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DESP17661 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
DESP17661 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DESP17661 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DESP17661 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DESP17661 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
DESP17661 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DESP17661 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DESP17661 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DESP17661 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DESP17661 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
DESP17661 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DESP17661 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DESP17661 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DESP17661 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DESP17661 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DESP17661 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DESP17661 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DESP17661 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DESP17661 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DESP17661 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DESP17661 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DESP17661 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DESP17661 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DESP17661 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DESP17661 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DESP17661 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DESP17661 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DESP17661 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DESP17661 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DESP17661 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DESP17661 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DESP17661 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DESP17661 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DESP17661 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DESP17661 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DESP17661 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DESP17661 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DESP17661 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DESP17661 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DESP17661 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DESP17661 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
DESP17661 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DESP17661 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DESP17661 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DESP17661 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DESP17661 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DESP17661 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DESP17661 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DESP17661 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DESP17661 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DESP17661 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
DESP17661 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DESP17661 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DESP17661 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DESP17661 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DESP17661 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DESP17661 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DESP17661 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DESP17661 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DESP17661 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DESP17661 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DESP17661 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DESP17661 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DESP17661 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DESP17661 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DESP17661 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DESP17661 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DESP17661 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DESP17661 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DESP17661 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DESP17661 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DESP17661 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DESP17661 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DESP17661 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DESP17661 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DESP17661 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DESP17661 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DESP17661 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DESP17661 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DESP17661 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DESP17661 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DESP17661 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DESP17661 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DESP17661 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DESP17661 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DESP17661 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DESP17661 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DESP17661 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DESP17661 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DESP17661 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DESP17661 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DESP17661 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DESP17661 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DESP17661 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DESP17661 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DESP17661 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DESP17661 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DESP17661 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DESP17661 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms