Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB1P16220 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB1P16220 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB1P16220 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB1P16220 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB1P16220 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB1P16220 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB1P16220 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB1P16220 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB1P16220 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB1P16220 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB1P16220 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB1P16220 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB1P16220 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB1P16220 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB1P16220 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB1P16220 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB1P16220 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB1P16220 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB1P16220 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB1P16220 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB1P16220 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB1P16220 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB1P16220 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB1P16220 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB1P16220 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB1P16220 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB1P16220 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB1P16220 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB1P16220 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB1P16220 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB1P16220 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB1P16220 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB1P16220 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB1P16220 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB1P16220 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB1P16220 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB1P16220 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB1P16220 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB1P16220 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB1P16220 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB1P16220 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB1P16220 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB1P16220 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB1P16220 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB1P16220 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB1P16220 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB1P16220 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB1P16220 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB1P16220 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB1P16220 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB1P16220 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB1P16220 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB1P16220 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB1P16220 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB1P16220 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB1P16220 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB1P16220 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB1P16220 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB1P16220 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB1P16220 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB1P16220 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB1P16220 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB1P16220 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB1P16220 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB1P16220 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB1P16220 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB1P16220 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB1P16220 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB1P16220 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB1P16220 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB1P16220 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB1P16220 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB1P16220 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB1P16220 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB1P16220 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB1P16220 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB1P16220 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB1P16220 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB1P16220 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB1P16220 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB1P16220 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB1P16220 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB1P16220 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB1P16220 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB1P16220 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB1P16220 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB1P16220 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB1P16220 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB1P16220 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB1P16220 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB1P16220 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB1P16220 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB1P16220 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB1P16220 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB1P16220 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB1P16220 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB1P16220 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB1P16220 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB1P16220 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms