Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAV1P15498 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAV1P15498 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAV1P15498 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
VAV1P15498 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
VAV1P15498 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
VAV1P15498 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAV1P15498 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAV1P15498 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAV1P15498 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAV1P15498 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAV1P15498 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAV1P15498 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAV1P15498 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAV1P15498 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
VAV1P15498 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAV1P15498 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAV1P15498 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAV1P15498 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAV1P15498 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAV1P15498 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAV1P15498 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAV1P15498 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAV1P15498 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAV1P15498 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAV1P15498 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAV1P15498 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAV1P15498 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAV1P15498 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAV1P15498 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAV1P15498 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAV1P15498 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
VAV1P15498 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAV1P15498 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAV1P15498 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAV1P15498 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAV1P15498 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAV1P15498 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAV1P15498 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAV1P15498 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAV1P15498 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAV1P15498 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAV1P15498 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAV1P15498 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAV1P15498 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
VAV1P15498 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAV1P15498 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAV1P15498 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAV1P15498 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAV1P15498 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAV1P15498 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAV1P15498 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAV1P15498 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAV1P15498 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAV1P15498 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAV1P15498 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAV1P15498 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAV1P15498 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAV1P15498 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAV1P15498 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAV1P15498 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAV1P15498 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAV1P15498 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAV1P15498 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAV1P15498 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAV1P15498 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAV1P15498 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAV1P15498 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
VAV1P15498 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAV1P15498 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAV1P15498 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAV1P15498 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAV1P15498 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAV1P15498 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAV1P15498 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAV1P15498 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAV1P15498 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAV1P15498 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAV1P15498 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
VAV1P15498 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAV1P15498 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAV1P15498 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAV1P15498 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAV1P15498 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAV1P15498 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAV1P15498 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAV1P15498 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAV1P15498 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAV1P15498 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAV1P15498 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAV1P15498 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAV1P15498 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAV1P15498 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VAV1P15498 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAV1P15498 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAV1P15498 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VAV1P15498 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VAV1P15498 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAV1P15498 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAV1P15498 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms