Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RLBP1P12271 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RLBP1P12271 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RLBP1P12271 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RLBP1P12271 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms