Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODC1P11926 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODC1P11926 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODC1P11926 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODC1P11926 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODC1P11926 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODC1P11926 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODC1P11926 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ODC1P11926 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODC1P11926 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODC1P11926 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODC1P11926 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODC1P11926 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODC1P11926 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODC1P11926 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODC1P11926 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODC1P11926 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODC1P11926 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODC1P11926 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODC1P11926 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ODC1P11926 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODC1P11926 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODC1P11926 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODC1P11926 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODC1P11926 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODC1P11926 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODC1P11926 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODC1P11926 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODC1P11926 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODC1P11926 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODC1P11926 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODC1P11926 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODC1P11926 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODC1P11926 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODC1P11926 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODC1P11926 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODC1P11926 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODC1P11926 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODC1P11926 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODC1P11926 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODC1P11926 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODC1P11926 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODC1P11926 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODC1P11926 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODC1P11926 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODC1P11926 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODC1P11926 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODC1P11926 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODC1P11926 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODC1P11926 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODC1P11926 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODC1P11926 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODC1P11926 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODC1P11926 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODC1P11926 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODC1P11926 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODC1P11926 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODC1P11926 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODC1P11926 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ODC1P11926 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODC1P11926 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODC1P11926 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODC1P11926 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODC1P11926 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODC1P11926 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ODC1P11926 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODC1P11926 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODC1P11926 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODC1P11926 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ODC1P11926 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODC1P11926 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ODC1P11926 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODC1P11926 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODC1P11926 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODC1P11926 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODC1P11926 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODC1P11926 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODC1P11926 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ODC1P11926 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODC1P11926 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODC1P11926 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODC1P11926 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODC1P11926 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODC1P11926 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODC1P11926 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODC1P11926 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODC1P11926 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODC1P11926 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODC1P11926 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODC1P11926 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODC1P11926 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODC1P11926 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODC1P11926 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODC1P11926 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODC1P11926 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODC1P11926 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODC1P11926 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODC1P11926 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODC1P11926 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODC1P11926 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms