Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GLI2P10070 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GLI2P10070 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GLI2P10070 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GLI2P10070 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GLI2P10070 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GLI2P10070 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GLI2P10070 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GLI2P10070 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GLI2P10070 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GLI2P10070 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GLI2P10070 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GLI2P10070 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GLI2P10070 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GLI2P10070 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GLI2P10070 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GLI2P10070 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GLI2P10070 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GLI2P10070 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GLI2P10070 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GLI2P10070 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GLI2P10070 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GLI2P10070 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GLI2P10070 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GLI2P10070 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GLI2P10070 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GLI2P10070 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GLI2P10070 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GLI2P10070 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GLI2P10070 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GLI2P10070 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GLI2P10070 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GLI2P10070 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GLI2P10070 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GLI2P10070 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GLI2P10070 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GLI2P10070 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GLI2P10070 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GLI2P10070 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GLI2P10070 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GLI2P10070 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GLI2P10070 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GLI2P10070 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GLI2P10070 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GLI2P10070 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GLI2P10070 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GLI2P10070 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GLI2P10070 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GLI2P10070 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GLI2P10070 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GLI2P10070 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GLI2P10070 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GLI2P10070 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GLI2P10070 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GLI2P10070 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GLI2P10070 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GLI2P10070 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GLI2P10070 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GLI2P10070 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GLI2P10070 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GLI2P10070 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GLI2P10070 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GLI2P10070 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GLI2P10070 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GLI2P10070 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GLI2P10070 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GLI2P10070 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GLI2P10070 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GLI2P10070 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GLI2P10070 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GLI2P10070 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GLI2P10070 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GLI2P10070 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GLI2P10070 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GLI2P10070 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GLI2P10070 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GLI2P10070 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GLI2P10070 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GLI2P10070 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GLI2P10070 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GLI2P10070 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GLI2P10070 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GLI2P10070 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GLI2P10070 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GLI2P10070 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GLI2P10070 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GLI2P10070 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GLI2P10070 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GLI2P10070 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GLI2P10070 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GLI2P10070 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GLI2P10070 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GLI2P10070 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GLI2P10070 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GLI2P10070 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GLI2P10070 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GLI2P10070 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GLI2P10070 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GLI2P10070 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GLI2P10070 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms