Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2BP0DI82 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms