Protein–RNA interactions for Protein: P09430

TNP1, Spermatid nuclear transition protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP1P09430 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TNP1P09430 C4orf33-201ENST00000281146 6170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TNP1P09430 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TNP1P09430 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TNP1P09430 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TNP1P09430 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TNP1P09430 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TNP1P09430 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TNP1P09430 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TNP1P09430 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TNP1P09430 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TNP1P09430 ABCC3-201ENST00000285238 5716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TNP1P09430 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TNP1P09430 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TNP1P09430 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TNP1P09430 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TNP1P09430 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TNP1P09430 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TNP1P09430 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TNP1P09430 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TNP1P09430 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TNP1P09430 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TNP1P09430 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TNP1P09430 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TNP1P09430 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TNP1P09430 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TNP1P09430 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TNP1P09430 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TNP1P09430 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TNP1P09430 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TNP1P09430 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TNP1P09430 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TNP1P09430 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TNP1P09430 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TNP1P09430 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TNP1P09430 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TNP1P09430 DLGAP1-212ENST00000515196 5314 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TNP1P09430 SON-201ENST00000300278 7477 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TNP1P09430 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TNP1P09430 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TNP1P09430 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TNP1P09430 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TNP1P09430 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TNP1P09430 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TNP1P09430 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TNP1P09430 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TNP1P09430 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TNP1P09430 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TNP1P09430 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TNP1P09430 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TNP1P09430 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TNP1P09430 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TNP1P09430 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TNP1P09430 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TNP1P09430 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TNP1P09430 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TNP1P09430 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TNP1P09430 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TNP1P09430 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TNP1P09430 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TNP1P09430 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TNP1P09430 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TNP1P09430 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TNP1P09430 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TNP1P09430 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TNP1P09430 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TNP1P09430 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TNP1P09430 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TNP1P09430 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TNP1P09430 PPFIA4-201ENST00000272198 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TNP1P09430 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TNP1P09430 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TNP1P09430 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TNP1P09430 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TNP1P09430 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TNP1P09430 DAG1-218ENST00000515359 5576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TNP1P09430 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TNP1P09430 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TNP1P09430 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TNP1P09430 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TNP1P09430 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TNP1P09430 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TNP1P09430 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TNP1P09430 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TNP1P09430 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TNP1P09430 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TNP1P09430 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TNP1P09430 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TNP1P09430 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TNP1P09430 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TNP1P09430 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TNP1P09430 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TNP1P09430 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TNP1P09430 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TNP1P09430 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TNP1P09430 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TNP1P09430 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TNP1P09430 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TNP1P09430 ERCC5-201ENST00000355739 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TNP1P09430 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms