Protein–RNA interactions for Protein: P09105

HBQ1, Hemoglobin subunit theta-1, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBQ1P09105 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBQ1P09105 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms