Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG7O95352 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG7O95352 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG7O95352 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG7O95352 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG7O95352 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG7O95352 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG7O95352 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG7O95352 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG7O95352 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG7O95352 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG7O95352 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG7O95352 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG7O95352 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG7O95352 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG7O95352 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG7O95352 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG7O95352 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG7O95352 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG7O95352 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG7O95352 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG7O95352 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG7O95352 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG7O95352 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG7O95352 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG7O95352 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG7O95352 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG7O95352 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG7O95352 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG7O95352 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG7O95352 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG7O95352 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG7O95352 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG7O95352 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG7O95352 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG7O95352 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG7O95352 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG7O95352 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG7O95352 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG7O95352 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG7O95352 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG7O95352 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG7O95352 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG7O95352 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG7O95352 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG7O95352 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG7O95352 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG7O95352 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG7O95352 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG7O95352 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG7O95352 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG7O95352 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG7O95352 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG7O95352 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG7O95352 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG7O95352 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG7O95352 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG7O95352 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG7O95352 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG7O95352 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG7O95352 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG7O95352 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG7O95352 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG7O95352 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG7O95352 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG7O95352 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG7O95352 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATG7O95352 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG7O95352 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG7O95352 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG7O95352 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG7O95352 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG7O95352 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG7O95352 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG7O95352 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG7O95352 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG7O95352 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG7O95352 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG7O95352 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG7O95352 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG7O95352 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG7O95352 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG7O95352 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG7O95352 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG7O95352 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG7O95352 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG7O95352 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG7O95352 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG7O95352 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG7O95352 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG7O95352 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG7O95352 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG7O95352 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG7O95352 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG7O95352 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG7O95352 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG7O95352 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG7O95352 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG7O95352 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG7O95352 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms