Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EDIL3O43854 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms