Protein–RNA interactions for Protein: O43852

CALU, Calumenin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALUO43852 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALUO43852 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALUO43852 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALUO43852 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALUO43852 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALUO43852 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALUO43852 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALUO43852 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALUO43852 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALUO43852 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALUO43852 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALUO43852 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALUO43852 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALUO43852 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALUO43852 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALUO43852 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALUO43852 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALUO43852 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALUO43852 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALUO43852 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALUO43852 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALUO43852 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALUO43852 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALUO43852 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALUO43852 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CALUO43852 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALUO43852 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALUO43852 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALUO43852 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALUO43852 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALUO43852 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALUO43852 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALUO43852 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALUO43852 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALUO43852 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALUO43852 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALUO43852 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALUO43852 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALUO43852 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALUO43852 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALUO43852 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALUO43852 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALUO43852 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALUO43852 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALUO43852 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALUO43852 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALUO43852 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALUO43852 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALUO43852 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALUO43852 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALUO43852 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALUO43852 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALUO43852 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALUO43852 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALUO43852 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALUO43852 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALUO43852 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALUO43852 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALUO43852 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALUO43852 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CALUO43852 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALUO43852 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALUO43852 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALUO43852 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CALUO43852 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALUO43852 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALUO43852 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALUO43852 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALUO43852 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALUO43852 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALUO43852 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALUO43852 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALUO43852 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALUO43852 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALUO43852 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALUO43852 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALUO43852 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALUO43852 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALUO43852 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALUO43852 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALUO43852 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALUO43852 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALUO43852 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALUO43852 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALUO43852 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALUO43852 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALUO43852 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALUO43852 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALUO43852 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALUO43852 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALUO43852 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALUO43852 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALUO43852 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALUO43852 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CALUO43852 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CALUO43852 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CALUO43852 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CALUO43852 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CALUO43852 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CALUO43852 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms