Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KDM6AO15550 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms