Protein–RNA interactions for Protein: G5E9R7

KRTAP4-16, HCG2042993, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-16G5E9R7 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP4-16G5E9R7 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP4-16G5E9R7 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP4-16G5E9R7 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP4-16G5E9R7 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP4-16G5E9R7 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
KRTAP4-16G5E9R7 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
KRTAP4-16G5E9R7 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
KRTAP4-16G5E9R7 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
KRTAP4-16G5E9R7 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
KRTAP4-16G5E9R7 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
KRTAP4-16G5E9R7 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
KRTAP4-16G5E9R7 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
KRTAP4-16G5E9R7 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
KRTAP4-16G5E9R7 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
KRTAP4-16G5E9R7 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP4-16G5E9R7 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms