Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 241.8 ms