Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms