Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms