Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
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C4orf47A7E2U8 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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C4orf47A7E2U8 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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C4orf47A7E2U8 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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C4orf47A7E2U8 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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C4orf47A7E2U8 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
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