Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CFAP73A6NFT4 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CFAP73A6NFT4 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms