Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L9A6NEM1 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms