Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F8A0AVK6 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms