Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00312Q9Y6C7 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms