Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG4BQ9Y4P1 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG4BQ9Y4P1 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG4BQ9Y4P1 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4BQ9Y4P1 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4BQ9Y4P1 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4BQ9Y4P1 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4BQ9Y4P1 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4BQ9Y4P1 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4BQ9Y4P1 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4BQ9Y4P1 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4BQ9Y4P1 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4BQ9Y4P1 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4BQ9Y4P1 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4BQ9Y4P1 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4BQ9Y4P1 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4BQ9Y4P1 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4BQ9Y4P1 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4BQ9Y4P1 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4BQ9Y4P1 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4BQ9Y4P1 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4BQ9Y4P1 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4BQ9Y4P1 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4BQ9Y4P1 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4BQ9Y4P1 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4BQ9Y4P1 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4BQ9Y4P1 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ATG4BQ9Y4P1 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ATG4BQ9Y4P1 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4BQ9Y4P1 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4BQ9Y4P1 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4BQ9Y4P1 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4BQ9Y4P1 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4BQ9Y4P1 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4BQ9Y4P1 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4BQ9Y4P1 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ATG4BQ9Y4P1 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ATG4BQ9Y4P1 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4BQ9Y4P1 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4BQ9Y4P1 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4BQ9Y4P1 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4BQ9Y4P1 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4BQ9Y4P1 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4BQ9Y4P1 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4BQ9Y4P1 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4BQ9Y4P1 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4BQ9Y4P1 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4BQ9Y4P1 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4BQ9Y4P1 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4BQ9Y4P1 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4BQ9Y4P1 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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ATG4BQ9Y4P1 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG4BQ9Y4P1 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG4BQ9Y4P1 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG4BQ9Y4P1 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG4BQ9Y4P1 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG4BQ9Y4P1 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG4BQ9Y4P1 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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ATG4BQ9Y4P1 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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ATG4BQ9Y4P1 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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ATG4BQ9Y4P1 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG4BQ9Y4P1 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG4BQ9Y4P1 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG4BQ9Y4P1 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG4BQ9Y4P1 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG4BQ9Y4P1 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG4BQ9Y4P1 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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