Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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UBE2J1Q9Y385 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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UBE2J1Q9Y385 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
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UBE2J1Q9Y385 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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UBE2J1Q9Y385 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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UBE2J1Q9Y385 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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UBE2J1Q9Y385 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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UBE2J1Q9Y385 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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UBE2J1Q9Y385 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2J1Q9Y385 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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