Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms