Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN30

SCML1, Sex comb on midleg-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML1Q9UN30 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCML1Q9UN30 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms