Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYTH4Q9UIA0 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms