Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM8A1Q9UBU6 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms