Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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