Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCHIP1Q9P0W5 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms