Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD7

PARVA, Alpha-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVAQ9NVD7 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PARVAQ9NVD7 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms