Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms