Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP50

FAM60A, Protein FAM60A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM60AQ9NP50 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM60AQ9NP50 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms