Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP29Q9HBJ7 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP29Q9HBJ7 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP29Q9HBJ7 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP29Q9HBJ7 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP29Q9HBJ7 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP29Q9HBJ7 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP29Q9HBJ7 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP29Q9HBJ7 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP29Q9HBJ7 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP29Q9HBJ7 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP29Q9HBJ7 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP29Q9HBJ7 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP29Q9HBJ7 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP29Q9HBJ7 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP29Q9HBJ7 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP29Q9HBJ7 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP29Q9HBJ7 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
USP29Q9HBJ7 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP29Q9HBJ7 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP29Q9HBJ7 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP29Q9HBJ7 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP29Q9HBJ7 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP29Q9HBJ7 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP29Q9HBJ7 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP29Q9HBJ7 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP29Q9HBJ7 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP29Q9HBJ7 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP29Q9HBJ7 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP29Q9HBJ7 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP29Q9HBJ7 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP29Q9HBJ7 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP29Q9HBJ7 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP29Q9HBJ7 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP29Q9HBJ7 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP29Q9HBJ7 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP29Q9HBJ7 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP29Q9HBJ7 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP29Q9HBJ7 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP29Q9HBJ7 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP29Q9HBJ7 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP29Q9HBJ7 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP29Q9HBJ7 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP29Q9HBJ7 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms