Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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