Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms