Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms