Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR6C74-201ENST00000343870 1105 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLDN20-201ENST00000367165 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 GTF3AP1-201ENST00000416942 1004 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL133325.2-201ENST00000431034 449 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 Z84478.1-201ENST00000438230 1219 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF195-208ENST00000438262 1018 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC089999.1-201ENST00000460336 374 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 INTS4-205ENST00000527522 956 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC60-203ENST00000536742 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL049829.2-201ENST00000554010 285 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
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KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
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KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
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KRTAP9-3Q9BYQ3 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
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KRTAP9-3Q9BYQ3 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM174-201ENST00000296776 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
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