Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms