Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQA5

HINFP, Histone H4 transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HINFPQ9BQA5 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HINFPQ9BQA5 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HINFPQ9BQA5 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HINFPQ9BQA5 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HINFPQ9BQA5 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HINFPQ9BQA5 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HINFPQ9BQA5 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HINFPQ9BQA5 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HINFPQ9BQA5 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HINFPQ9BQA5 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HINFPQ9BQA5 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HINFPQ9BQA5 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HINFPQ9BQA5 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HINFPQ9BQA5 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HINFPQ9BQA5 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HINFPQ9BQA5 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HINFPQ9BQA5 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HINFPQ9BQA5 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HINFPQ9BQA5 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HINFPQ9BQA5 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HINFPQ9BQA5 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HINFPQ9BQA5 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HINFPQ9BQA5 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HINFPQ9BQA5 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HINFPQ9BQA5 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HINFPQ9BQA5 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HINFPQ9BQA5 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HINFPQ9BQA5 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms