Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms