Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms