Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 CEACAM20-206ENST00000621342 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 P2RX1-201ENST00000225538 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 ZNF300-203ENST00000418587 3226 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 GBP1P1-201ENST00000394662 1740 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 WDR70-201ENST00000265107 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 MED29-201ENST00000315588 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 AGAP3-226ENST00000622464 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 AC090136.3-201ENST00000520834 2704 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 FCRLA-206ENST00000367949 1792 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 BTNL8-202ENST00000340184 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 FAIM2-205ENST00000550890 2094 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 FLNA-219ENST00000610817 7595 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 NLRC3-202ENST00000359128 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 NUTM2B-202ENST00000372321 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 SEMA4G-205ENST00000517724 2675 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 DIDO1-205ENST00000370371 2833 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 RUFY4-202ENST00000374155 2977 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 IQSEC1-204ENST00000613206 3582 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 RASAL1-203ENST00000446861 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 LMNA-206ENST00000368300 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 AIF1L-206ENST00000372302 3340 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 DENND2A-210ENST00000537639 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 GNG11-201ENST00000248564 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 HIST2H2BE-201ENST00000369155 2194 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 PER3-202ENST00000377532 6279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 PLEKHA6-202ENST00000414478 5091 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 ZNF423-207ENST00000567169 4017 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 HGNC:18790-209ENST00000513555 3291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 ABCC3-201ENST00000285238 5716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 ARMCX2-203ENST00000356824 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 LINC00969-213ENST00000445707 2363 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 NFASC-202ENST00000360049 10120 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 NFASC-225ENST00000539706 10135 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 FGFR1-211ENST00000425967 5375 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 TMEM200A-201ENST00000296978 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 ATP2A1-201ENST00000357084 3532 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 ARL4C-201ENST00000339728 3385 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 AGPAT3-203ENST00000398058 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 ANKRD17-202ENST00000358602 10784 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 C1orf216-201ENST00000270815 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 DNAJB5-210ENST00000545841 3068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 PLEC-201ENST00000322810 15249 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 SYBU-203ENST00000408889 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 TMEM25-208ENST00000524725 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 HDGFL3-201ENST00000299633 12733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 GZF1-202ENST00000377051 4740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 MID1IP1-204ENST00000614558 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 ERCC1-202ENST00000300853 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 EGR3-201ENST00000317216 4336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 SLC2A1-203ENST00000426263 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 XRCC3-202ENST00000553264 3018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 ABCA2-223ENST00000614293 8146 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 HAUS6-202ENST00000380502 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 ABL2-210ENST00000511413 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PRAC1Q96KF2 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms