Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC1

VPS39, Vam6/Vps39-like protein, humanhuman

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Length 886 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS39Q96JC1 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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VPS39Q96JC1 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS39Q96JC1 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS39Q96JC1 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS39Q96JC1 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS39Q96JC1 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS39Q96JC1 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS39Q96JC1 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS39Q96JC1 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS39Q96JC1 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS39Q96JC1 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS39Q96JC1 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS39Q96JC1 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS39Q96JC1 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS39Q96JC1 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS39Q96JC1 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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VPS39Q96JC1 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS39Q96JC1 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS39Q96JC1 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS39Q96JC1 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS39Q96JC1 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS39Q96JC1 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS39Q96JC1 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS39Q96JC1 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS39Q96JC1 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS39Q96JC1 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS39Q96JC1 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS39Q96JC1 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS39Q96JC1 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS39Q96JC1 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS39Q96JC1 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS39Q96JC1 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS39Q96JC1 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS39Q96JC1 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS39Q96JC1 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS39Q96JC1 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS39Q96JC1 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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VPS39Q96JC1 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS39Q96JC1 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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VPS39Q96JC1 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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VPS39Q96JC1 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS39Q96JC1 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS39Q96JC1 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS39Q96JC1 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS39Q96JC1 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VPS39Q96JC1 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS39Q96JC1 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS39Q96JC1 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS39Q96JC1 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS39Q96JC1 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS39Q96JC1 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS39Q96JC1 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS39Q96JC1 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS39Q96JC1 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS39Q96JC1 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS39Q96JC1 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS39Q96JC1 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS39Q96JC1 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS39Q96JC1 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS39Q96JC1 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VPS39Q96JC1 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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