Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms