Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMIGD2Q96BF3 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMIGD2Q96BF3 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMIGD2Q96BF3 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMIGD2Q96BF3 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMIGD2Q96BF3 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TMIGD2Q96BF3 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMIGD2Q96BF3 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TMIGD2Q96BF3 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TMIGD2Q96BF3 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMIGD2Q96BF3 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TMIGD2Q96BF3 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMIGD2Q96BF3 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMIGD2Q96BF3 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMIGD2Q96BF3 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMIGD2Q96BF3 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMIGD2Q96BF3 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMIGD2Q96BF3 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMIGD2Q96BF3 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMIGD2Q96BF3 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMIGD2Q96BF3 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMIGD2Q96BF3 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMIGD2Q96BF3 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TMIGD2Q96BF3 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TMIGD2Q96BF3 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TMIGD2Q96BF3 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TMIGD2Q96BF3 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TMIGD2Q96BF3 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TMIGD2Q96BF3 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIGD2Q96BF3 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIGD2Q96BF3 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIGD2Q96BF3 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIGD2Q96BF3 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIGD2Q96BF3 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIGD2Q96BF3 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIGD2Q96BF3 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIGD2Q96BF3 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIGD2Q96BF3 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIGD2Q96BF3 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIGD2Q96BF3 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIGD2Q96BF3 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIGD2Q96BF3 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIGD2Q96BF3 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIGD2Q96BF3 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIGD2Q96BF3 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIGD2Q96BF3 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIGD2Q96BF3 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIGD2Q96BF3 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIGD2Q96BF3 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIGD2Q96BF3 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIGD2Q96BF3 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIGD2Q96BF3 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIGD2Q96BF3 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIGD2Q96BF3 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIGD2Q96BF3 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIGD2Q96BF3 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIGD2Q96BF3 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIGD2Q96BF3 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIGD2Q96BF3 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIGD2Q96BF3 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIGD2Q96BF3 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIGD2Q96BF3 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMIGD2Q96BF3 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD2Q96BF3 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD2Q96BF3 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD2Q96BF3 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD2Q96BF3 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD2Q96BF3 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD2Q96BF3 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD2Q96BF3 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD2Q96BF3 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD2Q96BF3 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD2Q96BF3 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD2Q96BF3 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD2Q96BF3 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD2Q96BF3 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD2Q96BF3 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD2Q96BF3 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD2Q96BF3 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD2Q96BF3 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD2Q96BF3 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD2Q96BF3 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD2Q96BF3 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD2Q96BF3 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD2Q96BF3 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD2Q96BF3 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD2Q96BF3 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD2Q96BF3 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD2Q96BF3 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD2Q96BF3 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD2Q96BF3 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD2Q96BF3 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD2Q96BF3 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD2Q96BF3 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD2Q96BF3 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD2Q96BF3 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD2Q96BF3 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD2Q96BF3 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD2Q96BF3 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMIGD2Q96BF3 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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