Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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UBE2E3Q969T4 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
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