Protein–RNA interactions for Protein: Q969S8

HDAC10, Histone deacetylase 10, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC10Q969S8 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC10Q969S8 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms