Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF4BQ92750 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms