Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms